Студопедия

Главная страница Случайная страница

Разделы сайта

АвтомобилиАстрономияБиологияГеографияДом и садДругие языкиДругоеИнформатикаИсторияКультураЛитератураЛогикаМатематикаМедицинаМеталлургияМеханикаОбразованиеОхрана трудаПедагогикаПолитикаПравоПсихологияРелигияРиторикаСоциологияСпортСтроительствоТехнологияТуризмФизикаФилософияФинансыХимияЧерчениеЭкологияЭкономикаЭлектроника






  • Сервис онлайн-записи на собственном Telegram-боте
    Тот, кто работает в сфере услуг, знает — без ведения записи клиентов никуда. Мало того, что нужно видеть свое расписание, но и напоминать клиентам о визитах тоже. Нашли самый бюджетный и оптимальный вариант: сервис VisitTime.
    Для новых пользователей первый месяц бесплатно.
    Чат-бот для мастеров и специалистов, который упрощает ведение записей:
    Сам записывает клиентов и напоминает им о визите;
    Персонализирует скидки, чаевые, кэшбэк и предоплаты;
    Увеличивает доходимость и помогает больше зарабатывать;
    Начать пользоваться сервисом
  • Пит.10. Роль вторинної структури в утворенні глобули.






    Локальну конформацію амінокислотного ланцюга називають вторинною структурою білка. Певна частина (іноді значна) ланцюга міститься в нерегулярній конформації. Але в глобулярних білках завжди зустрічаються також регулярні конформації, стабілізовані водневими зв'язками між пептидними групами, і термін вторинна структура іноді відносять саме до них. Загалом у глобулярних білках представлено всього два типи таких конформацій α -спіраль і β -структура, хоча є також інші.

    α -Спіраль Одна з допустимих конформацій на карті Рамачандрана передбачає наближення оксигену пептидної групи і-го залишку до NH-групи і + 4. Перша група є акцептором водневого зв'язку, друга донором. Система таких водневих зв'язків між кожним і та і + 4 залишком стабілізує регулярну конформацію, яка й називається α -спіраллю. Ця спіраль є правою, на один виток припадає 3, 6 амінокислотного залишку, довжина одного витка вздовж осі 5, 4 Å. Водневий зв'язок між пептидними групами замикає в кільце 13 атомів чотирьох залишків: відповідно, α -спіраль позначається також як спіраль 413. α -Спіраль можна приблизно уявити як циліндр діаметром ≈ 10 Å, на поверхні

    якого розташовані амінокислотні залишки. Оскільки найімовірніша локальна конформація ланцюга залежить від послідовності, різні амінокислоти та їхні комбінації мають різний потенціал щодо включення в α -спіраль. Наприклад, Pro не може бути включеним до α -спіралі. Gly також уникає регулярних структур, оскільки втратив би свою високу конформаційну свободу. При цьому в глобулярних білках спостерігається закономірність: гідрофобні амінокислотні залишки згруповані на поверхні спіралі в більш-менш суцільний гідрофобний кластер. Тобто α -спіраль переважно утворюється на таких ділянках послідовності з високим спіральним потенціалом, які здатні сформувати гідрофобний кластер на поверхні спіралі Така закономірність пояснюється просто. Унаслідок конкуренції з молекулами води водневі зв'язки між пептидними групами у водному оточенні не є дуже стабільними. Адже утворення спіралі коштує енергетичних витрат ñ зниження ентропії за рахунок обмеження конформаційної свободи. А водневі зв'язки у присутності води не здатні суттєво компенсувати ці витрати. Якщо ж на поверхні спіралі є гідрофобний кластер, він прагне адсорбувати іншу гідрофобну поверхні. Тоді частина пептидних груп і водневих зв'язків між ним опиняється в неполярному оточенні, що суттєво стабілізує і ці зв'язки, і α -спіраль. У результаті у глобулі залишаються лише α -спіралі з гідрофобним кластером на поверхні. Це вказує, що формування регулярної вторинної структури та укладання в глобулу єдиний процес. Нижче при обговоренні глобулярної структури буде розглянуто питання про те, чому взагалі утворюється регулярна вторинна структура в глобулярних білках.

    β -Структура Інший тип регулярної вторинної структури, який часто зустрічається в білках, ñ це β -структура. Вона складається з витягнутих фрагментів поліпептидного ланцюга: кілька таких фрагментів β -тяжів утворюють β -структурний шар, у площині якого розташовані водневі зв'язки між пептидними групами тяжів, а від обох поверхонь відходять амінокислотні залишки Половина пептидних груп β -тяжів, які містяться на межах шару, залишаються ненасиченими водневими зв'язками. Тому чим більше тяжів входить до складу шару, тим більш стабільним він є. β -Шар може бути антипаралельним або паралельним.

    Спіраль 3\10.Права спіраль 3\10 (водневий зв'язок між і та і + 3 залишками) зустрічається не дуже часто у вигляді коротких (3-4) фрагментів.

    β -Поворот. β -Поворот або β -вигин (β -turn) ñ невеликий елемент ланцюга із чотирьох залишків, стабілізований водневим зв'язком між пептидними групами першого та четвертого. β -Поворот забезпечує поворот ланцюга на 180° і часто знаходиться між двома сусідніми β -тяжами в антипаралельних β -шпильках.






    © 2023 :: MyLektsii.ru :: Мои Лекции
    Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав.
    Копирование текстов разрешено только с указанием индексируемой ссылки на источник.