IHF r5(m)

gatcagaatgagggg ttatacaca actcaaaaactgaa caacagttgttc tttggataa ct

ctagtctttctcccc aatatgtgt tgagtttttgacttgttgtcaacaag AaACCTATT ga

R2 Fis R3

accggttgatccaagcttcctgacagag ttatccaca gtagatcgcac

tggccaactaggttcgaaggactgtctc aataggtgc catctagcgtg

R4

Рис. 3.2. Минимальная область начала репликации oriC E. coli.

Вертикальными линиями отмечены границы минимальной области ori. Cайты GATC изображены прописными буквами, а блоки DnaA (R1-R5) -подчеркутыми прописными буквами и указана их ориентациия (строчными буквами в этих блоках отмечены отклонения от консенсусной последовательности 5'-ТТАТССАСА). Курсивом с подчеркиванием обозначены сайты связывания белков IHF и Fis. Двусторонние стрелки отмечают положения АТ-богатых областей (АТ-участка и 13-меров L, M и R). Подчеркнутыми жирными буквами набраны сайты связывания DnaA-АТФ и стрелками указана их ориентация